L'audit qualité réalisé en 2010 sur le partenariat GéoBretagne a permis de faire progresser le partenariat, en interrogeant les membres.
Une des conséquences concrètes a été la refonte de la charte GéoBretagne en avril 2011. Cette nouvelle version a notamment permis d'instaurer une nouvelle gouvernance basée sur une assemblée générale annuelle réunissant tous les membres, et un comité exécutif, instance dédiée à l'Etat et la Région Bretagne en charge du partenariat.